Cromwell no Parlamento
Cromwell já havia se tornado conhecido no Parlamento de 1628-1629 como um feroz e Puritano um tanto rude, que lançou um ataque aos bispos de Carlos I. Ele acreditava que o cristão individual poderia estabelecer contato direto com Deus por meio da oração e que o principal dever do clero era inspirar os leigos pela pregação. Assim, ele contribuiu de seu próprio bolso para o apoio de pregadores protestantes itinerantes ou “conferencistas” e mostrou abertamente sua antipatia por seu bispo local em Ely, um líder do partido da Alta Igreja, que defendia a importância do ritual e da autoridade episcopal Ele criticou o bispo na Câmara dos Comuns e foi nomeado membro de um comitê para investigar outras queixas contra ele. Cromwell, de fato, desconfiava de toda a hierarquia da Igreja da Inglaterra, embora nunca se opusesse a uma igreja estatal. Ele, portanto, defendeu a abolição da instituição do episcopado e a proibição de um ritual definido, conforme prescrito no Livro de Oração Comum. Ele acreditava que as congregações cristãs deveriam ter permissão para escolher seus próprios ministros, que deveriam servi-los com pregação e oração extemporânea.
A eleição de Cromwell para o Os parlamentos de 1640 (ver Short Parliament; Long Parliament) para o bairro de Cambridge foram certamente o resultado de ligações estreitas entre ele e puritanos radicais no conselho municipal. No Parlamento, ele reforçou sua reputação de religioso cabeça quente ao promover reformas radicais. Na verdade, ele foi muito franco para os líderes da oposição, que pararam de usá-lo como porta-voz após os primeiros meses do Longo Parlamento.
De fato, embora Cromwell compartilhasse as queixas de seus companheiros sobre impostos, monopólios e outros encargos impostos ao povo, foi sua religião que primeiro o colocou em oposição ao governo do rei. Quando, em novembro de 1641, John Pym e seus amigos apresentaram ao rei Carlos I uma “Grande Remonstrância”, consistindo de mais de 200 cláusulas, entre as quais uma censura aos bispos “e à parte corrupta do clero, que preza a formalidade e a superstição” em apoio de sua própria “tirania e usurpação eclesiástica”, Cromwell declarou que, se não tivesse sido aprovado pela Câmara dos Comuns, ele teria vendido tudo o que tinha “na manhã seguinte e nunca mais teria visto a Inglaterra”.
A Remonstrância não foi aceita pelo rei e o abismo entre ele e seus principais críticos na Câmara dos Comuns aumentou. Um mês depois, Charles tentou em vão prender cinco deles por traição: Cromwell ainda não era suficientemente proeminente para estar entre eles. Mas quando em 1642 o rei deixou Londres para formar um exército, e os eventos se encaminharam para uma guerra civil, Cromwell começou a se distinguir não apenas como um puritano franco, mas também como um homem prático, capaz de organização e liderança. Em julho, ele obteve permissão da Câmara dos Comuns para permitir que seu eleitorado de Cambridge formasse e armasse companhias para sua defesa. Em agosto, ele próprio cavalgou para Cambridge para impedir que as faculdades enviassem seu prato para ser derretido em benefício do rei , e assim que a guerra começou, ele alistou uma tropa de cavalaria em sua cidade natal de Huntingdon. Como capitão, ele fez sua primeira aparição com sua tropa nos estágios finais da Batalha de Edgehill (23 de outubro de 1642), onde Robert Devereux, 3º conde de Essex, foi o comandante-chefe do Parlamento na primeira grande disputa da guerra.