Beagle, brittiskt marinfartyg ombord på vilket Charles Darwin tjänstgjorde som naturforskare på en resa till Sydamerika och runt om i världen (1831–36). Proverna och observationerna som ackumulerats under denna resa gav Darwin de väsentliga materialen för sin evolutionsteori genom naturligt urval.
HMS Beagle (det tredje av nio fartyg som bär det här namnet) lanserades den 11 maj 1820 vid Woolwich, platsen för kungliga flottans hamnar på R iver Thames nära London. Fartyget var utformat som en flankdäckad 10-kanons brig (ett tvåmastat fartyg avsett för scouting, kurirtjänst och andra ljusuppdrag). Den bar åtta 18-pund karronader och två 6-pund långa kanoner; dess längd var 90 fot 4 tum (cirka 28 meter), dess balk 24 fot 6 tum (cirka 8 meter). Vid sjögranskningen av kung George IV 1820 blev det det första skeppet som passerade helt riggat under den gamla London Bridge.
1825 omvandlades Beagle till en bark genom tillägg av en liten mizzenmast; en prognos och en stor bajsstuga tillkom också. För sin första uppdrag (1826–30) skickades den under ledning av löjtnant Pringle Stokes på en resa för att kartlägga Sydamerikas kuster tillsammans med HMS Adventure. Efter Stokes självmord vid Kap Horn 1828 utsågs löjtnant Robert Fitzroy till kapten.
Fitzroy befallde Beagles andra resa (1831–36), med Darwin som naturforskare. För denna uppdrag, som skulle innebära en omkörning av Sydamerika och sedan världen, genomgick fartyget en större ombyggnad. Huvuddäckets höjd höjdes till en fot och en två-tums (fem cm) mantel av gran tillsattes till skrovet. Experimentell utrustning – inklusive en patentspis och ankarspel, kedjor istället för rep (där så är lämpligt) och blixtledare – installerades. Totalt 10 officerare, 4 midskeppare och volontärer, 38 sjömän och pojkar, 8 marinister och 8 supernumerarier (inklusive Darwin) startade resan (fartyget var så trångt att Darwin fick sova i en hängmatta som slungades ovanför ritbordet i bajsstuga). Darwins stora samling av fossiler och växt- och djurprover klämdes in i prognosen.
Målet för resan var att få en fullständig cirkel av längdmätningar, en prestation som kräver användning av 22 kronometrar och uppnås inom endast 33 sekunder efter fel. Fitzroy slutförde också de sydamerikanska undersökningarna som inleddes på Beagles första resa och returnerade tre indianer som han hade tagit från ön Tierra del Fuego 1830. År 1833 hjälpte HMS Beagle, Clio och Tyne britterna att ta kontroll över Falklandsöarna. från argentinerna.
Under fartygets tredje resa (1837–43) gjorde löjtnanterna John Clements Wickham och John Lort Stokes de första fullständiga undersökningarna av Australiens kuster (inklusive Port Darwin och Fitzroy River). År 1845 avlägsnades Beagle-masten och förtöjdes i Essex-myrarna för att användas av Kustbevakningstjänsten som en vaktstation mot smugglare. Det döptes om till Watch Vessel 7 1863 och såldes för skrot 1870. En del av dess virke kan fortfarande ligga i Themsens mynning.