Ativismo e prisão domiciliar
Em julho de 1989, o governo militar da recém-nomeada União de Mianmar (desde 2011, República da União de Mianmar) colocou Suu Kyi em prisão domiciliar em Yangon (Rangoon) e manteve-a incomunicável. Os militares se ofereceram para libertá-la se ela concordasse em deixar Mianmar, mas ela se recusou a fazê-lo até que o país fosse devolvido ao governo civil e os prisioneiros políticos fossem libertados. A Liga Nacional para a Democracia (NLD), que Suu Kyi havia fundado em 1988, ganhou mais de 80% das cadeiras parlamentares contestadas em 1990, mas os resultados dessa eleição foram ignorados pelo governo militar (em 2010, o governo militar anulou formalmente os resultados das eleições de 1990). A notícia de que Suu Kyi estava recebendo o Prêmio Nobel provocou intensa calúnia por parte do governo e, como ela ainda estava detida, seu filho, Alexander Aris, aceitou o prêmio em seu lugar.
Suu Kyi foi libertada da prisão domiciliar em julho de 1995, embora houvesse restrições à sua capacidade de viajar para fora de Yangon. No ano seguinte, ela participou do congresso do partido NLD, mas o governo militar continuou a perseguir tanto ela quanto seu partido. Em 1998, ela anunciou a formação de um comitê representativo que ela declarou ser o parlamento governante legítimo do país. Michael Aris morreu em Londres no início de 1999. Antes de sua morte, a junta militar negou-lhe um visto para visitar Suu Kyi em Mianmar, e Suu Kyi, antecipando que ela não teria permissão para voltar ao país se partisse, permaneceram em Mianmar .
Richard Vogel — AP / .com
A junta mais uma vez colocou Suu Kyi em prisão domiciliar de setembro de 2000 a maio de 2002, ostensivamente por ter violado as restrições ao tentar viajar para fora de Yangon. Após confrontos entre o NLD e manifestantes pró-governo em 2003, o governo a devolveu para prisão domiciliar. Os apelos por sua libertação continuaram em toda a comunidade internacional em face da renovação anual de sua sentença, e em 2009 um órgão das Nações Unidas declarou sua detenção ilegal de acordo com a própria lei de Mianmar. Em 2008, as condições de sua prisão domiciliar foram um tanto afrouxadas, permitindo-lhe receber algumas revistas, bem como cartas de seus filhos, que moravam no exterior.
Em maio de 2009, pouco antes de sua sentença mais recente foi para ser concluído, Suu Kyi foi presa e acusada de ter violado os termos de sua prisão domiciliar depois que um intruso (um cidadão americano) entrou em seu complexo residencial e passou duas noites lá. Em agosto, ela foi condenada e sentenciada a três anos de prisão, embora a sentença tenha sido imediatamente reduzida para 18 meses, e ela foi autorizada a cumpri-la enquanto permanecia em prisão domiciliar. No momento de sua condenação, era generalizada a crença dentro e fora de Mianmar de que esta última decisão foi projetada para impedir Suu Kyi de participar das eleições parlamentares multipartidárias (as primeiras desde 1990) marcadas para 2010.
Que a suspeita se tornou realidade por meio de uma série de novas leis eleitorais promulgadas em março de 2010: uma proibia indivíduos de qualquer participação nas eleições se tivessem sido condenados por um crime (como ela havia sido em 2009), e outra desqualificava qualquer pessoa que fosse (ou tivesse sido ) casado com um estrangeiro de se candidatar a um cargo. Em apoio a Suu Kyi, o NLD recusou-se a registrar-se novamente de acordo com essas novas leis (conforme exigido) e foi dissolvido. Os partidos do governo enfrentaram pouca oposição nas eleições de 7 de novembro de 2010 e facilmente conquistaram uma esmagadora maioria de assentos legislativos em meio a alegações generalizadas de fraude eleitoral. Suu Kyi foi libertada da prisão domiciliar seis dias após a eleição e jurou continuar sua oposição ao regime militar.