Efter Girondins fald, blev Montagnards tilbage til at håndtere landets desperate position. Truet indefra af bevægelsen for føderalisme og af borgerkrigen i Vendée i nordvest og truet ved grænserne af den anti-franske koalition, mobiliserede revolutionen sine ressourcer til sejr. I sin dagbog bemærkede Robespierre, at det, der var nødvendigt, var “une volonté une” (“en enkelt vilje”), og denne diktatoriske magt skulle karakterisere den revolutionære regering. Dens væsentlige organer var skabt, og han satte sig til at få dem til at fungere.
Fra La Guillotine en 1793 af Hector Fleischmann, 1908
Den 27. juli 1793 indtog Robespierre sin plads i Udvalget for Offentlig Sikkerhed, som først var nedsat i april. Mens nogle af hans kolleger var væk på mission, og andre var optaget af specielle opgaver, stræbte han efter at forhindre splittelse blandt de revolutionære ved at stole på de jakobinske samfund og årvågenhedskomiteerne. Fremover skulle hans handlinger være uadskillelige fra regeringens som helhed. Som præsident for Jacobin Club og derefter for National Convention fordømte han planerne for de parisiske radikaler kendt som Enragés, der brugte madmangel til at opveje Paris-sektionerne. Robespierre besvarede demonstranterne den 5. september ved at love maksimumspriser for alle fødevarer og en revolutionær milits til brug i det indre mod kontrarevolutionærer og kornholdere.
For at skabe en masseplikt, økonomisk diktatur og total krig bad han om at intensivere terrorperioden. Men han protesterede mod meningsløse henrettelser og beskyttede de stedfortrædere, der havde protesteret mod arrestationen af Girondinerne og kongens søster. Han blev syg af massakrene, der blev kondoneret af de repræsentanters mission (medlemmer af den nationale konvention sendt for at bryde oppositionen i provinserne) og krævede deres tilbagekaldelse for at “vanære revolutionen.”
Robespierre helligede sin rapport om 5 Nivôse, år II (25. december 1793), til retfærdiggørelse af det nationale kongres kollektive diktatur, administrativ centralisering og udrensning af lokale myndigheder. Han protesterede mod de forskellige fraktioner, der truede regeringen. Hébertisterne, Cordeliers og de populære militante opfordrede alle til mere radikale tiltag og opmuntrede til afkristning og retsforfølgelse af madoplagere. Deres overdrivelse skræmte bønderne, som ikke kunne have været tilfredse med dekreterne fra 8. og 13. Ventôse, år II (26. februar og marts) 3, 1794), som indeholdt bestemmelser om fordeling blandt de fattige af mistænktes ejendom.
Han kom igen til Jacobin-klubben efter en måneds sygdom, og Robespierre fordømte adical revolutionist Jacques-René Hébert og hans tilhængere, der sammen med nogle udenlandske agenter blev henrettet i marts. De, der, ligesom Georges Danton, ville standse terrorperioden og krigen angreb politik for Udvalget for Offentlig Sikkerhed med stigende vold. Selvom Robespierre stadig var tøvende, førte den nationale konvention mod disse såkaldte overbærenheder. De dantonistiske ledere og de deputerede, der var kompromitteret i likvidationen af det franske østindiske kompagni, blev guillotineret den 16. Germinal (5. april).
JE Bulloz
En deist i stil med Jean-Jacques Rousseau , Robespierre afviste den antikristne bevægelse og fornuftens kult “maskerader”. I en rapport til den nationale konvention i maj bekræftede han eksistensen af Gud og sjælens udødelighed og stræbte efter at samle revolutionærerne omkring et borgerlig religion og kulten af det højeste væsen. At han forblev ekstremt populær, fremgår af de offentlige ovationer, han modtog efter Henri Admirats mislykkede forsøg på sit liv den 3. prærie (22. maj). Den nationale konvent valgte ham til præsident den 16. prærie ( 4. juni) ved en stemme på 216 ud af 220. I denne egenskab ledede han det højeste væsens festival (“Etre suprême”) i Tuileries Gardens den 20. Prairial (8. juni), som skulle give hans fjender en anden våben mod ham.