I 1608 rejste kaptajn John Smith 170 miles fra Jamestown (etableret året før) og udforskede bredder, floder, åer og vandløb til den øvre Chesapeake Bay mod Susquehanna-floden, leder den første europæiske ekspedition til Patapsco-floden, opkaldt efter de indfødte Algonquian-folk, der fiskede skaldyr og jagtede.
Engelsk kongelig og proprietær jordtilskud fra 1661 blev kombineret i 1702 af James Carroll, der kaldte den Whetstone Point, fordi af landformen, der ligner en slibesten. Området er nu kendt som Locust Point, et bolig- og industriområde. Havnen blev grundlagt på dette sted i 1706 af den koloniale generalforsamling i provinsen Maryland og udpeget som en af de officielle indgangshavne til tobakshandel med kongeriget England. I 1729–1730 blev punktet indarbejdet i den nyoprettede Baltimore Town mod nordvest ved “The Basin” i den nordvestlige gren af Patapsco. Dette område blev senere kendt som den indre havn.
I 1776 opførte lokale borgere jordarbejder til havneforsvar under den amerikanske uafhængighedskrig kendt som Fort Whetstone. Disse havnebefæstninger blev erstattet begyndende i 1798. Desuden blev Fort McHenry udvidet og rekonstrueret med mursten og sten i en “stjernefort” -form. Dette arbejde blev udført af officerer og ingeniører fra den amerikanske hær og dets ingeniørkorps og det amerikanske krigsministerium.
Ser nordpå den voksende by Baltimore mod “The Basin” (senere Indre havn) i den nordvestlige gren af Patapsco-floden med et tidligt dampskib med sideskovlhjul, der er anbragt under højderne af Federal Hill i 1849 med det gamle Baltimore Cathedral (senere Basilica of the Assumption of Mary) (til venstre) og Washington Monument (center) i det fjerne dominerer byen.
Fells Point, først navngivet Long Island Point i 1670 er det dybeste punkt i den naturlige havn på nordkysten af den nordvestlige gren af Patapsco. Det blev snart koloniens vigtigste skibsbygningscenter med mange skibsværfter, der var berømt for opførelsen af den unikke stylede Baltimore-klipper med mindre sejlskonnert. Disse var berygtede, da de blev brugt af handelsraiders og private. Denne form for aktivitet førte til det britiske angreb i september 1814 under krigen i 1812 kendt som slaget ved Baltimore. Det er kendt for den berømte bombardement af Fort McHenry samt et landangreb mod sydøst i slaget ved North Point, der angreb befæstninger mod øst side af byen ved Loudenschlager “s og Potter” s Hills (i dag “s Hampstead Hill / Patterson Park). Fells Point blev indarbejdet i gamle Baltimore Town i 1773. Den kontinentale flåde bestilte deres første fregat krigsskib, USS Virginia, fra George Wells ved Fells Point i 1775. Det første skib ved navn USF Constellation blev produceret på Harris Creek skibsværft øst for Fells Point (stedet for det fremtidige kvarter i Canton) af en skibsfører fra Hingham, Massachusetts ved navn David Stodder. Den tredje USS Enterprise blev bygget på Henry Spencers skibsværft. Over 800 skibe blev bestilt fra Fells Point skibsværfter fra 1784 til 1821. California Gold Rush fra 1848–1849 førte til mange ordrer på hurtige skibe. Mange pionerer på land var også afhængige af dåse varer leveret fra Baltimore fabrikker.
Nye biler, der venter på afsendelse, 1973
Efter grundlæggelsen af Baltimore udviklede havnefronten tørdokke, pakhuse, skibshandlere samt industri, herunder møller, blev bygget bag kajerne. I det, der nu er Canton, længere sydøst for Baltimore og Fells Point langs Patapsco River, John O “Donnells” plantage blev udviklet i begyndelsen af 1800erne til arbejderboliger og industri, herunder Canton Iron Works ejet af Peter Cooper og senere Horace Abbott under borgerkrigen og andre.
I 1828 Baltimore og Ohio Railroad (B & O) begyndte sporlægning til sidst strakte sig ind i Locust Point i 1845. Ankomsten af Baltimore og Ohio og andre jernbaner gjorde havnen til et stort omladningssted mellem indre punkter og resten af verden. I 1840erne leverede Baltimore Steam Packet Company (“Old Bay Line”) dampskibstjeneste natten over Chesapeake Bay. Efter borgerkrigen blev kaffeskibe designet her til handel med Brasilien.Andre industrielle aktiviteter i Canton omfattede Baltimore Copper Smelting Company og små olieraffinaderier, senere købt af Standard Oil. Ved slutningen af det nittende århundrede havde europæiske skibslinjer terminaler for emigranter fra Storbritannien, Irland, Tyskland og Polen.
Havnekanaler og tilgange Rediger
Vedligeholdelse af havnekanaler og navigationshjælpemidler begyndte tidligt.Udgravning i havnen kan spores helt tilbage til 1783, da Ellicott-brødrene (af Ellicott Dredges) udgravede bunden ved deres kaj i den indre havn. I 1790 begyndte statsregeringen systematisk opmudring ved hjælp af en “muddermaskine”, der brugte en hestevogn, der senere blev opgraderet med dampkraft. I 1825 anmodede senator Sam Smith fra Maryland Kongressen om føderal støtte til dette arbejde.
Luftfoto af port
Port of Baltimore, 2014
På dette tidspunkt var Kongressen smarte fra angrebene fra krigen i 1812 og havde besluttet at udvide flådeforsvaret. I Baltimore førte det til den fejlagtige opførelse af Fort Carroll, en ø tre-lags murværk i 1840erne (svarende til forskellige andre østkyst ø-forter bygget som det berømte Fort Sumter i Charleston havn, South Carolina), overvåget af den unge oberst Robert E. Lee fra United States Army Corps of Engineers, men føderale uddybningsbevillinger gik forud for dette projekt, begyndende i 1830. Dette første projekt blev afsluttet i 1838. I 1850erne blev der udført et andet udmudringsprojekt, denne gang under kaptajn Henry Brewerton , som også senere var ansvarlig for Fort Carroll-projektet. Han udgravede en lige kanal fra Sparrows Point ud til mundingen af Patapsco nær Seven Foot Knoll Light mellem North Point og Hawkins Point, som blev rejst i 1855; denne kanal, der i dag er kendt som Brewerton Channel, er fortsat det centrale led i stien til havnen.
I 1865 overtog majestet William P. Craighill over som Baltimore District Engineer for Corps of Engineers. Hans oprindelige undersøgelse af Brewerton Channel afslørede svær stimulation ved mundingen af floden, og han udgravede en ny kanal startende fra den ældre kanal på et punkt lige nordvest for Seven Foot Knoll og løb sydpå til mundingen af Magothy River, hvor den vendte sig mod syd-sydøst og fortsatte til Sandy Point, lige nord for den nuværende placering af Chesapeake Bay Bridge. I 1870erne blev der gravet en afskåret kanal for at forbedre drejningen mellem den gamle og den nye kanal; Brewerton Channel blev også udvidet til at give en forbindelse til Chesapeake og Delaware Canal. Brewerton og Craighill Channels blev udvidet og udvidet til at få adgang til forskellige faciliteter i havnen og fortsætter med at bruge den til i dag, i det væsentlige uændret i konfiguration.
Føderal fyrtårnkonstruktion i bugten begyndte i 1820erne og et tidligt projekt var opstillingen af rækkevidde lys til at lede skibe ind i Patapsco. Disse lys, North Point Range Lights, blev tændt i 1822 og markerede en sti, der var omtrent den samme som den nuværende Craighill Cutoff Channel. Efterfølgende kanalopbygning blev kort efterfulgt af lette projekter. Brewertons kanal blev præget af Hawkins Point og Leading Point-lysene, bygget i 1868 og konverteret til skelettårne i 1924. Den oprindelige (nederste) Craighill Channel blev markeret med afstandslys i 1875 efter to års midlertidige lyskibe; afskæringen blev markeret med de øvre rækkevidde lys i 1886, der erstattede North Point rækkevidde, som var blevet afbrudt i 1873. I de senere år blev et par skelet tårne rejst på Locust Point for at markere Fort McHenry Channel, det sidste ben fra slutningen af Brewerton-kanalen til Curtis Point og den indre havn. Alle disse lys forbliver i brug, selvom alle selvfølgelig er automatiseret. Craighill Channel Lower Range Rear Light nyder forskellen på at være det højeste fyr i Maryland.
I 2006 deltog daværende Marylands guvernør Bob Ehrlich i at udnævne havnen efter Helen Delich Bentley under havnens 300-års jubilæum.