Nonsyndrom holoprosencephaly er en abnormitet i hjerne 
udvikling, der også påvirker hoved og ansigt. Normalt deler hjernen sig i to halvdele (halvkugler ) under tidlig udvikling. Holoprosencephaly opstår, når hjernen ikke deler sig ordentligt i højre og venstre halvkugle. Denne tilstand kaldes ikke-syndromisk for at skelne den fra andre typer holoprosencephaly forårsaget af genetiske syndromer, kromosomabnormiteter eller stoffer, der forårsager fosterskader (teratogener). Alvorligheden af ikke-syndromisk holoprosencephaly varierer meget blandt berørte individer, selv inden for den samme familie.
Ikke-syndromisk holoprosencephaly kan grupperes i fire typer alt efter graden af hjernedeling. Fra mest til mindst alvorlig er typerne kendt som alobar , semi-lobar , lobar og midterste interhemisfæriske variant (MIHV). I de mest alvorlige former for ikke-syndromisk holoprosencephaly deler hjernen slet ikke. Disse berørte individer har et centralt øje (cyclopia) og en rørformet næsestruktur (snabel) placeret over øjet. De fleste babyer med svær nonsyndrom holoprosencephaly dør før fødslen eller kort efter. I de mindre alvorlige former deles hjernen delvist, og øjnene sættes normalt tæt på hinanden (hypotelorisme). Forventet levetid for disse berørte individer varierer afhængigt af symptomernes sværhedsgrad.
Mennesker med ikke-syndromisk holoprosencephaly har ofte et lille hoved (microcephaly), skønt de kan udvikle væskeopbygning i hjernen (hydrocephalus), forårsager øget hovedstørrelse (makrocephali). Andre funktioner kan omfatte en åbning i munden (kløft ) med eller uden splittelse i overlæben (kløft ), en central fortand i stedet for to (en enkelt maxillær central fortand ) og en flad næsebro. Øjenkuglerne kan være unormalt små (microphthalmia) eller fraværende (anophthalmia).
Nogle personer med ikke-syndromisk holoprosencephaly har et karakteristisk mønster af ansigtsegenskaber, herunder en indsnævring af hovedet ved templerne “>
, udvendige hjørner af øjnene, der peger opad (opadvendte palpebrale sprækker ), store ører, en kort næse med vendte næsebor og et bredt og dybt mellemrum mellem næse og mund (philtrum). Generelt er sværhedsgraden af ansigtsegenskaber direkte relateret til sværhedsgraden af hjernens abnormiteter. Imidlertid kan personer med let berørte ansigtsegenskaber have alvorlige hjerneabnormiteter. Nogle mennesker har ikke tilsyneladende strukturelle hjerneabnormiteter, men har nogle af ansigtsegenskaberne forbundet med denne tilstand. Disse personer anses for at have en form for forstyrrelse kendt som mikroform holoprosencephaly og identificeres typisk efter fødslen af et alvorligt ramt familiemedlem.
De fleste mennesker med ikke-syndromisk holoprosencephaly har udviklingsforsinkelse og intellektuel handicap. Berørte individer har ofte en funktionsfejl i hypofysen, som er en kirtel placeret i hjernens bund, der producerer flere hormoner. Fordi hypofysefunktion fører til delvis eller fuldstændig fravær af disse hormoner, kan det forårsage en række lidelser. Oftest udvikler mennesker med ikke-syndrom holoprosencephaly og hypofysedysfunktion diabetes insipidus, en tilstand, der forstyrrer balancen mellem væskeindtag og urinudskillelse. Dysfunktion i andre dele af hjernen kan forårsage anfald, fodringsproblemer og problemer med at regulere kropstemperatur, puls og vejrtrækning. Lugtsansen kan være nedsat (hyposmi) eller helt fraværende (anosmi), hvis den del af hjernen, der behandler lugte, er underudviklet eller mangler.