De fossile beviser
Bortset fra den oprindelige opdagelse af den 1,8 millioner år gamle kæbe, kraniet og hånden knogler fra en ung person kaldet Olduvai Hominid 7 (OH 7), er yderligere fossiler fra Olduvai blevet tilskrevet H. habilis. Stykker af en anden tyndvægget kranium sammen med øvre og nedre kæber og tænder kom frem i 1963. Bare en måned senere blev der fundet en tredje kranium, men knoglerne blev trampet af kvæg efter at være vasket i en kløft. Nogle af tænderne overlevede, men kraniet blev brudt i mange små fragmenter; kun toppen af hjernehovedet, eller hvælvet, er samlet igen. Disse to kranier hedder OH 13 og OH 16.
Siden 1964 er der blevet opdaget mere materiale. En spændende prøve er OH 24, som også var fra Olduvai og dateret til ca. 1,8 mya. Dette kranium er mere komplet end andre fra Olduvai. Fordi nogle af knoglerne er knust og forvrænget, er ansigtet og hjernekassen imidlertid skævt. OH 24 kan afvige fra Australopithecus i hjernestørrelse og tandkarakteristika, men det ligner australopiths i det sydlige Afrika i andre funktioner, såsom ansigtets form.
Vigtige opdagelser i Koobi Fora-regionen i det nordlige Kenya inkluderer en kontroversiel kranium kaldet KNM-ER 1470 (Kenya National Museum – East Rudolf), som blev opdaget i 1972 og dateret til 1,9 mya. Prøven ligner både Australopithecus og Homo. Som i tilfældet med OH 16 var denne prøve blevet brudt i mange fragmenter, som kun kunne samles efter omfattende sigtning af aflejringerne. Nogle af stykkerne blev derefter monteret i rekonstruktionen af et ansigt og meget af et stort hvælving. Hjernevolumen kan måles ret nøjagtigt og er cirka 750 kubik cm (cc) eller 46 kubikcentimeter. Dette bevis fik nogle paleoanthropologer til at beskrive ER 1470 som en af de ældste utvivlsomste repræsentanter for slægten Homo, fordi nogle andre funktioner i hjernefallet også er homo-lignende. Samtidig er det tydeligt, at ansigtsskelettet er relativt stort og fladt i sine nedre dele. I denne henseende ligner Koobi Fora-prøven Australopithecus anatomisk.
Blandt andre vigtige fund fra Koobi Fora-regionen er KNM-ER 1813 og KNM-ER 1805. Begge blev opdaget i 1973 med ER 1813 dateret til 1,9 mya og ER 1805 dateret til 1,7 mya . Førstnævnte, som er det meste af et kranium, er mindre end ER 1470 og ligner OH 13 i mange detaljer, herunder tandstørrelse og morfologi. Sidstnævnte kraniet udviser nogle ejendommelige træk. Selvom hjernekassen af ER 1805 er tæt på 600 cc (36,6 kubikcentimeter) i volumen og udvides således moderat ud over den størrelse, der forventes i Australopithecus, løber en knoglet kam langs toppen af kraniet. Denne sagittale kam er kombineret med en anden fremtrædende kam orienteret over bagsiden af kraniet. Disse kamme indikerer, at tyggemusklerne og nakkemusklerne var stærkt udviklet. Et lignende, hvis mere overdrevet mønster af cresting vises i de såkaldte robuste australopiths, men ikke i Homo. Andre funktioner i ER 1805 er dog homo-lignende. Som et resultat har der været uenighed blandt anatomer om de hominin-arter, som denne person skulle tildeles. På trods af dets anomalier diskuteres ER 1805 ofte sammen med andre prøver grupperet som H. habilis.
Flere underkæber, der ligner OH 7, er blevet genvundet fra Koobi Fora-området og tænder, der kan høre hjemme til H. habilis er fundet længere mod nord i Omo-floddalen i Etiopien. Noget ekstra materiale, herunder et hårdt knust kranium, er kendt fra hulen ved Swartkrans i Sydafrika. På Swartkrans blandes fossilerne med mange andre knogler af robuste australopiths. En tidlig Homo-art kan også være til stede ved Sterkfontein, ikke langt fra Swartkrans. Også her er resterne fragmentariske og ikke særlig informative.
En mere værdifuld opdagelse blev rapporteret fra Olduvai Gorge i 1986. En kæbe med tænder og kraniet fragmenter samt stykker af højre arm og begge ben var fundet. Knoglerne ser ud til at repræsentere et individ, dateret til 1,8 mya og kaldet OH 62. Selvom kraniet er knust, bevares nok af ansigtet til at antyde ligheder med den tidlige Homo. Fundet er især vigtigt på grund af lemmerne, som viser, at OH 62 var et meget lille hominin. Armen er lang i forhold til benet, hvilket resulterer i kropsproportioner, der adskiller sig dramatisk fra mere moderne hominins.
En af de mere vigtige opdagelser fra det 21. århundrede omfattede en kæbe, der blev fundet på Ledi-Geraru forskningssted i Etiopiens Awash-floddal i 2013, som kunne være den ældste kendte prøve, der tilskrives H. habilis. Dateret til 2,8-2,75 mya, det besidder nogle af de primitive træk, der forekommer i Australopithecus, mens de også indeholder afledte træk (såsom mindre tænder og en meget reduceret hage) forbundet med senere arter af Homo. Prøven har vist sig at være nyttig til at bygge bro over det næsten en million år lange kløft i datering mellem fossiler forbundet med A. afarensis og fossiler forbundet med Homo. Imidlertid er mange paleontologer – inklusive opdageren, den amerikanske paleontolog Brian Villmoare – tøvende med at forbinde det utvetydigt med H. habilis, indtil der findes yderligere rester.