Beagle, britisk flådeskib om bord, som Charles Darwin tjente som naturforsker på en rejse til Sydamerika og rundt om i verden (1831–36). Prøver og observationer akkumuleret på denne rejse gav Darwin de væsentlige materialer til sin evolutionsteori ved naturlig udvælgelse.
HMS Beagle (den tredje af ni skibe, der bærer dette navn) blev lanceret den 11. maj 1820 på Woolwich, stedet for Royal Navys værfter på R iver Thames nær London. Skibet blev designet som en flush-decked, 10-gun brig (et to-mastet skib beregnet til spejdring, kurertjeneste og andre lette opgaver). Den bar otte 18-pund karronader og to 6 pund lange kanoner; dens længde var 90 fod 4 tommer (ca. 28 meter), dens bjælke 24 fod 6 tommer (ca. 8 meter). Ved flådevurderingen for kong George IV i 1820 blev det det første skib, der passerede fuldt rigget under den gamle London Bridge.
I 1825 blev Beagle omdannet til en bark ved tilføjelse af en lille mizzenmast; der blev også tilføjet en skovl og en stor kakkekabine. For sin første kommission (1826–30) blev den sendt under kommando af løjtnant Pringle Stokes på en rejse for at undersøge Sydamerikas kyster ledsaget af HMS Adventure. Efter Stokes selvmord på Cape Horn i 1828 blev løjtnant Robert Fitzroy udnævnt til kaptajn.
Fitzroy befalede Beagles anden rejse (1831–36) med Darwin som naturforsker. For denne kommission, som ville involvere en omgåelse af Sydamerika og derefter kloden, gennemgik skibet en større ombygning. Hoveddækkets højde blev hævet en fod, og der blev tilføjet en to-tommers kappe af gran til skroget. Eksperimentelt udstyr – herunder en patentovn og ankerspil, kæder i stedet for reb (hvor det er relevant) og lynledere – blev installeret. I alt 10 officerer, 4 midtskibsfolk og frivillige, 38 sømænd og drenge, 8 marinesoldater og 8 supernumerier (inklusive Darwin) startede rejsen (skibet var så overfyldt, at Darwin måtte sove i en hængekøje, der blev hængt over udkastbordet i bækkenhytte). Darwins store samling af fossiler og plante- og dyreeksemplarer blev klemt ind i prognosen.
Et mål for rejsen var at opnå en komplet cirkel af målinger af længdegrad, en bedrift, der kræver brug af 22 kronometre og udføres inden for kun 33 sekunder efter fejl. Fitzroy afsluttede også de sydamerikanske undersøgelser, der blev påbegyndt på Beagles første rejse og returnerede tre indianere, som han havde taget fra øen Tierra del Fuego i 1830. I 1833 hjalp HMS Beagle, Clio og Tyne briterne med at tage kontrol over Falklandsøerne. fra argentinerne.
Under skibets tredje rejse (1837–43) foretog løjtnanter John Clements Wickham og John Lort Stokes de første fulde undersøgelser af Australiens kyster (inklusive Port Darwin og Fitzroy-floden). I 1845 blev Beagle frataget sine master og fortøjet i Essex-sumpene til brug for Coast Guard Service som en overvågningsstation mod smuglere. Det blev omdøbt til urskib 7 i 1863 og solgt til skrot i 1870. Nogle af dets tømmer ligger muligvis stadig i Themses flodmunding.