Po pádu Girondinů byli Montagnardové ponecháni, aby se vypořádali se zoufalstvím země. pozice. Revoluce, ohrožená zevnitř hnutím za federalismus a občanskou válkou ve Vendée na severozápadě a ohrožena na hranicích protifrancouzskou koalicí, zmobilizovala své zdroje k vítězství. Robespierre ve svém deníku poznamenal, že bylo potřeba „une volonté une“ („jediná vůle“), a touto diktátorskou mocí bylo charakterizovat revoluční vládu. Byly vytvořeny jeho základní orgány a on se rozhodl dát jim pracovat.
27. července 1793 zaujal Robespierre místo ve Výboru pro veřejnou bezpečnost, který byl poprvé zřízen v dubnu. Zatímco někteří jeho kolegové byli na misích a jiní se zabývali zvláštními úkoly, snažil se zabránit rozdělení mezi revolucionáře tím, že se spoléhal na jakobínské společnosti a výbory pro bdělost. Jeho jednání mělo být nadále neoddělitelné od jednání vlády jako celku. Jako prezident Jacobin Clubu a poté Národního shromáždění odsoudil plány pařížských radikálů známých jako Enragés, kteří pomocí nedostatku potravin rozvířili pařížské sekce. Robespierre 5. září odpověděl demonstrantům tím, že slíbil maximální ceny všech potravin a revoluční milice pro použití ve vnitrozemí proti kontrarevolucionářům a hromaditelům obilí.
S cílem dosáhnout masové branné povinnosti, ekonomické diktatury a celkové války požádal o zintenzivnění vlády teroru. Ale namítal proti nesmyslným popravám, chránícím ty poslance, kteří protestovali proti zatčení Girondinů a královy sestry. Zhoršily ho masakry, které odpustili zástupci na misi (členové Národního shromáždění vyslaní k rozbití opozice v provinciích) a požadoval jejich odvolání za „zneužití revoluce“.
Robespierre věnoval svou zprávu o 5 Nivôse, ročník II (25. prosince 1793), k ospravedlnění kolektivní diktatury Národního shromáždění, správní centralizaci a očištění místních úřadů. Protestoval proti různým frakcím, které ohrožovaly vládu. Hébertisté, Cordeliersové a populární ozbrojenci vyzývali k radikálnějším opatřením a podporovali odkresťančení a stíhání hromaditelů potravin. Jejich excesy vyděsily rolníky, které nemohly potěšit dekrety z 8. a 13. Ventôse, rok II (26. února a března 3, 1794), který stanovil rozdělení majetku podezřelých mezi chudé.
Když se Robespierre znovu objevil v klubu Jacobin po měsíční nemoci, odsoudil r adikální revolucionář Jacques-René Hébert a jeho stoupenci, kteří byli spolu s některými zahraničními agenty popraveni v březnu. Ti, kteří chtěli, jako Georges Danton, zastavit vládu teroru a válku, zaútočili na politiku Výboru pro veřejnou bezpečnost s rostoucím násilím. Robespierre, přestože stále váhal, vedl národní shromáždění proti těmto takzvaným shovívavcům. Dantonističtí vůdci a poslanci, kteří byli kompromitováni při likvidaci francouzské Východoindické společnosti, byli gilotováni 16. Germinal (5. dubna).
Deist ve stylu Jean-Jacques Rousseau Robespierre nesouhlasil s protikřesťanským hnutím a „maškarádami“ kultu rozumu. V květnové zprávě před Národním shromážděním potvrdil existenci Boha a nesmrtelnost duše a usiloval o shromáždění revolucionářů kolem občanské náboženství a kult Nejvyšší bytosti. To, že zůstal nesmírně populární, dokládají veřejné ovace, kterých se mu dostalo po neúspěšném pokusu Henriho Admirata o život 3. Prairial (22. května). Národní shromáždění ho zvolilo prezidentem 16. Prairial ( 4. června), poměrem hlasů 216 z 220. V této funkci vedl festival Nejvyšší bytosti („Etre suprême“) v Tuilerijských zahradách 20. dubna (8. června), který měl svým nepřátelům poskytnout další zbraň proti němu.