Podle Eunice Kennedy Shriverové, když se Rosemary v roce 1940 vrátila do Spojených států ze Spojeného království, ustoupila; Shriver později uvedla, že Rosemary se stala „„ stále podrážděnější a obtížnější “ve věku 22 let. Rosemary často během tohoto období pociťovala křeče a vrhala se do prudkých vzteků, v nichž zasáhla a zranila ostatní. Poté, co byla vyloučena z letního tábora v západním Massachusetts a zůstala jen několik měsíců na internátní škole ve Filadelfii, byla Rosemary poslána do klášterní školy ve Washingtonu, D.C., Rosemary začala v noci vyklouzávat z klášterní školy. Jeptišky v klášteře si myslely, že Rosemary může být zapletená s muži a že by mohla nakazit pohlavně přenosnou chorobou nebo otěhotnět. Její občas nevyzpytatelné chování frustrovalo její rodiče; její otec se obzvláště obával, že chování Rosemary by zahanbilo a ztrapnilo rodinu a poškodilo politickou kariéru jeho i jeho dětí.
Když měla Rosemary 23 let, lékaři řekli jejímu otci, že forma psychochirurgie známá jako lobotomie by pomohla uklidnit její výkyvy nálady a zastavit její občasné násilné výbuchy. Joseph Kennedy rozhodl, že Rosemary by měla podstoupit lobotomii; o tomto rozhodnutí však svou manželku informoval až po ukončení řízení. Procedura proběhla v listopadu 1941. James W. Watts, který proceduru prováděl u Waltera Freemana (oba na Lékařské fakultě Univerzity George Washingtona), popsal postup autorovi Ronaldovi Kesslerovi následovně:
Prošli jsme temenem hlavy, myslím, že Rosemary byla vzhůru. Měla mírný sedativum. Udělal jsem chirurgický řez v mozku lebkou. Bylo to blízko vpředu. Bylo to na obou stranách. Právě jsme udělali malý řez, ne více než jeden palec. „Nástroj, který dr. Watts použil, vypadal jako nůž na máslo. Houpal jím nahoru a dolů, aby odřízl mozkovou tkáň.„ Dali jsme nástroj dovnitř, „řekl. „Watts cut, Dr. Freeman položil Rosemary několik otázek. Například ji požádal, aby přednesla modlitbu Páně nebo zazpívala„ Bůh žehnej Americe “nebo počítala pozpátku. „Udělali jsme odhad, jak daleko snížit podle toho, jak odpověděla.“ Když Rosemary začala být nesouvislá, přestali.
Dr. Watts Kesslerovi řekl, že podle jeho názoru Rosemary netrpěla mentální retardací, ale spíše formou deprese. Recenze všech článků, které napsali dva lékaři, potvrdila prohlášení Dr. Wattsa. U všech pacientů, které oba lobotomizovali, byla diagnostikována psychiatrická forma. Dr. Bertram S. Brown, ředitel Národního institutu Mental Health, který byl dříve asistentem prezidenta Kennedyho, řekl Kesslerovi, že Joe Kennedy odkazoval na svou dceru Rosemary jako na mentálně retardovanou spíše než na duševně nemocnou, aby chránil Johnovu reputaci prezidentského běhu a že nedostatek rodiny podpora duševních chorob je součástí celoživotního rodinného popírání toho, co tomu tak skutečně bylo. “
Rychle vyšlo najevo, že postup nebyl úspěšný. Kennedyho duševní kapacita se snížila na dvouletou -staré dítě. Nemohla chodit ani mluvit srozumitelně a byla inkontinentní.
AftermathEdit
Po lobotomii byla Rosemary okamžitě institucionalizována. Zpočátku žila několik let v Craig House, soukromé psychiatrické léčebně, hodinu a třicet minut severně od New Yorku. V roce 1949 byla přemístěna do Jeffersonu ve Wisconsinu, kde po zbytek svého života žila na půdě školy pro výjimečné děti St. Coletta (dříve známé jako „Institut pro zaostalou mládež“ St. Coletta). Arcibiskup Richard Cushing vyprávěl svému otci o ústavu sv. Coletty pro více než tři sta osob se zdravotním postižením a její otec cestoval a postavil pro ni soukromý dům asi míli mimo hlavní kampus sv. Colety poblíž Alverna Dům, který byl určen pro dospělé, kteří potřebovali celoživotní péči. Jeptišky dům nazývaly „chata Kennedyho“. Dvě katolické jeptišky, sestra Margaret Ann a sestra Leona, jí poskytovaly péči spolu se studentkou a ženou, která tři noci v týdnu pracovala s Rosemary na keramice. Rosemary měla auto, které bylo možné použít k jízdě, a psa, kterého mohla vzít na procházky.
V reakci na její stav ji rodiče Rosemary oddělili od rodiny. Rose Kennedyová navštěvovat ji 20 let Joseph P. Kennedy st. nenavštívil svou dceru v ústavu. Rosemary: The Hidden Kennedy Daughter, autorka Kate Clifford Larson uvedla, že Rosemaryina lobotomie byla před rodinou dvacet let skryta; nikdo z jejích sourozenců nevěděl o jejím pobytu. Zatímco její starší bratr John bojoval za znovuzvolení do Senátu v roce 1958, rodina Kennedyových vysvětlila svou nepřítomnost tvrzením, že je samotářská.Rodina Kennedyových veřejně vysvětlila její nepřítomnost až v roce 1961, poté, co byl John zvolen prezidentem. Kennedysová neodhalila, že byla institucionalizována kvůli neúspěšné lobotomii, ale místo toho uvedla, že je považována za „mentálně retardovanou“. V roce 1961, poté, co Joseph P. Kennedy, Sr. utrpěl mozkovou příhodu, která mu nedovolila mluvit, byli sourozenci Rosemary informováni o jejím umístění. Její lobotomie se stala veřejně známou až v roce 1987.