Cromwell v parlamentu
Cromwell se již stal známým v parlamentu v letech 1628–29 jako ohnivý a poněkud hrubý Puritán, který zahájil útok na biskupy Karla I. Věřil, že jednotlivý křesťan může navázat přímý kontakt s Bohem prostřednictvím modlitby a že hlavní povinností duchovenstva bylo inspirovat laiky kázáním. Z vlastní kapsy tedy přispěl na podporu potulných protestantských kazatelů nebo „lektorů“ a otevřeně projevil svou nechuť k místnímu biskupovi v Ely, vůdci strany vysoké církve, která stála za významem rituální a biskupské autority Kritizoval biskupa ve sněmovně a byl jmenován členem výboru, který by vyšetřoval další stížnosti proti němu. Cromwell ve skutečnosti nedůvěřoval celé hierarchii anglikánské církve, ačkoli nikdy nebyl proti státní církvi. Proto prosazoval zrušení institutu episkopátu a zákaz stanoveného rituálu, jak je předepsáno v knize Obyčejné modlitby, a věřil, že křesťanským sborům by mělo být umožněno zvolit si své vlastní služebníky, kteří by jim měli sloužit kázáním a modlitbami předčasně.
Cromwellovo zvolení do Parlamenty z roku 1640 (viz krátký parlament; dlouhý parlament) pro čtvrť v Cambridge byly bezpochyby výsledkem úzkých vazeb mezi ním a radikálními puritány v městské radě. V parlamentu posílil svou pověst náboženské horké hlavy podporou radikálních reforem. Ve skutečnosti byl příliš otevřený pro vůdce opozice, kteří ho po prvních měsících dlouhého parlamentu přestali používat jako ústní projev.
Opravdu, ačkoli Cromwell sdílel stížnosti svých kolegů daně, monopoly a další břemeno uvalené na lidi, to bylo jeho náboženství, které ho poprvé přivedlo do opozice vůči královské vládě. Když v listopadu 1641 John Pym a jeho přátelé představili králi Karlovi I. „Velkou remonstraci“, skládající se z více než 200 klauzulí, mezi nimiž byla i jedna cenzurující biskupy, a zkorumpovaná část duchovenstva, která si váží formality a pověry jejich vlastní „církevní tyranie a uzurpace“, prohlásil Cromwell, že pokud by to nebylo schváleno dolní sněmovnou, prodal by všechno, co měl, „příštího rána a nikdy by Anglii více neviděl.“
Král nepřijal Remonstrance a propast mezi ním a jeho předními kritiky ve sněmovně se rozšířila. O měsíc později se Charles marně pokusil zatknout pět z nich za velezradu: Cromwell ještě nebyl dostatečně prominentní, aby byl mezi nimi. Ale když v roce 1642 král opustil Londýn, aby získal armádu, a události směřovaly k občanské válce, Cromwell se začal odlišovat nejen jako otevřený puritán, ale také jako praktický člověk schopný organizace a vedení. V červenci získal povolení od Dolní sněmovny, aby umožnil svému volebnímu obvodu v Cambridge zformovat a vyzbrojit společnosti na jeho obranu, v srpnu sám odjel do Cambridge, aby zabránil vysokým školám poslat talíř, aby byl roztaven ve prospěch krále Jakmile začala válka, narukoval do svého rodiště v Huntingdonu oddíl kavalérie. Jako kapitán se poprvé objevil se svým oddílem v závěrečných fázích bitvy u Edgehill (23. října 1642), kde byl Robert Devereux, 3. hrabě z Essexu, vrchním velitelem parlamentu v první velké válečné soutěži.