Dopo la caduta dei Girondini, i Montagnard furono lasciati a fare i conti con i disperati del paese posizione. Minacciata dallinterno dal movimento per il federalismo e dalla guerra civile in Vandea nel nord-ovest e minacciata alle frontiere dalla coalizione antifrancese, la Rivoluzione ha mobilitato le sue risorse per la vittoria. Nel suo diario, Robespierre ha notato che ciò che era necessario era “une volonté une” (“un solo testamento”), e questo potere dittatoriale doveva caratterizzare il governo rivoluzionario. I suoi organi essenziali erano stati creati e lui si decise a farli funzionare.
Il 27 luglio 1793 Robespierre prese il suo posto nel Comitato di Pubblica Sicurezza, che era stato istituito per la prima volta in aprile. Mentre alcuni dei suoi colleghi erano in missione e altri erano occupati di incarichi speciali, si sforzò di prevenire la divisione tra i rivoluzionari facendo affidamento sulle società giacobine e sui comitati di vigilanza. Dora in poi le sue azioni sarebbero state inseparabili da quelle del governo nel suo insieme. Come presidente del Jacobin Club e poi della Convenzione Nazionale, ha denunciato i piani dei radicali parigini noti come Enragés, che usavano la scarsità di cibo per fomentare le sezioni parigine. Robespierre ha risposto ai manifestanti il 5 settembre promettendo prezzi massimi per tutti i prodotti alimentari e una milizia rivoluzionaria da utilizzare allinterno contro controrivoluzionari e accaparratori di grano.
Al fine di realizzare una coscrizione di massa, dittatura economica e totale guerra, ha chiesto di intensificare il regno del terrore. Ma si oppose a esecuzioni inutili, proteggendo quei deputati che avevano protestato contro larresto dei Girondini e della sorella del re. Era disgustato dai massacri condonati dai rappresentanti in missione (membri della Convenzione nazionale inviati per spezzare lopposizione nelle province) e ha chiesto il loro richiamo per “aver disonorato la Rivoluzione”.
Robespierre ha dedicato il suo rapporto di 5 Nivôse, anno II (25 dicembre 1793), per giustificare la dittatura collettiva della Convenzione Nazionale, la centralizzazione amministrativa e leliminazione delle autorità locali. Protestò contro le varie fazioni che minacciavano il governo. Gli hebertisti, i Cordeliers e i militanti popolari chiedevano tutti misure più radicali e incoraggiavano la scristianizzazione e il perseguimento degli accumulatori di cibo. I loro eccessi spaventarono i contadini, che non avrebbero potuto essere soddisfatti dai decreti dell8 e 13 Ventôse, anno II (26 febbraio e marzo 3, 1794), che prevedeva la distribuzione tra i poveri dei beni degli indagati.
Ricomparendo al Jacobin Club dopo un mese di malattia, Robespierre denunciò il r il rivoluzionario rivoluzionario Jacques-René Hébert e i suoi seguaci, che insieme ad alcuni agenti stranieri furono giustiziati a marzo. Coloro che volevano, come Georges Danton, fermare il regno del terrore e la guerra hanno attaccato le politiche del Comitato di Pubblica Sicurezza con crescente violenza. Robespierre, sebbene ancora titubante, guidò la Convenzione nazionale contro questi cosiddetti indulgenti. I leader dantonisti e i deputati che erano stati compromessi nella liquidazione della Compagnia francese delle Indie Orientali furono ghigliottinati il 16 Germinal (5 aprile).
Un deista nello stile di Jean-Jacques Rousseau , Robespierre disapprovava il movimento anticristiano e le “mascherate” del culto della ragione. In un rapporto alla Convenzione nazionale di maggio, affermava lesistenza di Dio e limmortalità dellanima e si sforzava di riunire i rivoluzionari attorno a un la religione civica e il culto dellEssere Supremo. Che sia rimasto estremamente popolare è dimostrato dalle ovazioni pubbliche che ha ricevuto dopo il fallito attentato alla sua vita il 3 Prairial (22 maggio). La Convenzione Nazionale lo ha eletto presidente, il 16 Prairial ( 4 giugno), con un voto di 216 su 220. In questa veste ha guidato la festa dellEssere Supremo (“Etre suprême”) nei giardini delle Tuileries il 20 Prairial (8 giugno), che doveva fornire ai suoi nemici un altro unarma contro di lui.