Pacjenci z ZA wyglądają normalnie po urodzeniu. W pierwszych 6 miesiącach noworodka mogą wystąpić trudności z karmieniem i hipotonia, a następnie opóźnienie rozwoju między 6 miesiącem a 2 rokiem życia. Zwykle od 1 roku życia rozwijają się typowe cechy ZZSK: poważny deficyt intelektualny, brak mowy, wybuchy śmiechu z trzepotaniem rąk, małogłowie, makrostomia, hipoplazja szczęki, rokowanie i problemy neurologiczne z chodem marionetkowym, ataksja i napady padaczkowe ze specyficznymi nieprawidłowościami w elektroencefalogramie (EEG) (trójfazowa aktywność delta z maksimum w obszarach czołowych). Inne objawy, które zostały opisane, to radosne zachowanie, nadpobudliwość bez agresji, krótka koncentracja uwagi, pobudliwość i problemy ze snem ze zmniejszoną potrzebą snu, zwiększoną wrażliwością na ciepło, pociąganie i fascynację wodą. Wraz z wiekiem typowe cechy choroby stają się mniej wyraźne z powodu szorstkości twarzy, skoliozy klatki piersiowej i problemów z poruszaniem się. Skoliozę klatki piersiowej stwierdza się u 40% pacjentów z ZA (głównie kobiet). Napady nadal występują u dorosłych pacjentów, ale poprawia się nadpobudliwość, krótka koncentracja uwagi i problemy ze snem. U pacjentów z delecją regionu 15q11 często występuje hipopigmentacja tęczówki i naczyniówki.