Poliittinen ura Stalinin johdolla
Vuonna 1925 Hruštšov aloitti kokopäiväisen puolueen työn Petrovsko-Mariinskin puoluesihteereinä Yuzovkan piiri. Hän erottui ahkerasta työstään ja tietämyksestään minun ja tehtaan olosuhteista. Pian hän huomasi Joseph Stalinin läheisen yhteistyökumppanin, Ukrainan puolueen keskuskomitean pääsihteerin Lazar M. Kaganovichin, joka pyysi Hruštšovia tulemaan mukaan äänestämättömänä edustajana Moskovan 14. puoluekongressissa. Seuraavat neljä vuotta – Juzovkassa, sitten Harkovassa (nykyinen Harkov) ja Kiovassa – Hruštšov toimi aktiivisesti juhlien järjestäjänä. Vuonna 1929 hän sai luvan mennä Moskovaan opiskelemaan metallurgiaa Stalinin teollisuusakatemiassa. Siellä hänet nimitettiin akatemian puoluekomitean sihteeriksi. Vuonna 1931 hän palasi kokopäiväiseen juhlatyöhön Moskovaan. Vuoteen 1933 mennessä hänestä oli tullut Moskovan aluekomitean toinen sihteeri.
1930-luvun alkupuolella Hruštšov vahvisti osuutensa Moskovan puolueen jäljettömistä. Hän valvoi Moskovan metron valmistumista, josta hän sai Leninin ritarikunnan vuonna 1935. Sinä vuonna hänestä tuli Moskovan kaupungin ja alueellisen puolueorganisaation – tosiasiallisesti Moskovan kuvernöörin – ensimmäinen sihteeri. Edellisenä vuonna, 17. puoluekongressissa, hänet oli valittu täysivaltaiseksi jäseneksi Neuvostoliiton kommunistisen puolueen (CPSU) 70 miehen keskuskomiteaan.
Hruštšov kannatti innokkaasti Stalin noina vuosina ja osallistui puolueen johtajuuden puhdistuksiin. Hän oli yksi kolmesta maakunnan sihteeristä, jotka selviytyivät 1930-luvun suuren puhdistuksen joukkotapahtumista. Hänestä tuli perustuslakikomitean jäsen vuonna 1936, Keskikomitean hallitsevan poliittisen toimiston varajäsen vuonna 1937 ja samana vuonna korkeimman neuvoston ulkoasiainvaliokunnan jäsen. Vuotta myöhemmin Hruštšovista tehtiin poliittisen toimiston ehdokasjäsen ja lähetettiin Kiovaan ukrainalaisen puoluejärjestön ensimmäisenä sihteerinä. Vuonna 1939 hänestä tuli poliittisen toimiston täysjäsen.
Vuonna 1940, kun Neuvostoliiton joukot olivat miehittäneet Itä-Puolan, Hruštšov toimi tämän alueen ”integroimiseksi” Neuvostoliittoon. Hänen päätavoitteena oli selvittää sekä Puolan että Ukrainan kansallismieliset liikkeet sekä palauttaa suurpuhdistuksessa hajonnut Ukrainan kommunistisen puolueen organisaatio, jonka Saksan hyökkäys Neuvostoliittoon kesäkuussa 1941. keskeytti tämän työn. Hruštšovin ensimmäinen sodanajan tehtävä Hänen oli tarkoitus evakuoida mahdollisimman suuri osa Ukrainan teollisuudesta itään. Sen jälkeen hänet liitettiin Neuvostoliiton armeijaan kenraaliluutnantiksi; hänen pääasiallisena tehtävänään oli stimuloida siviiliväestön vastarintaa ja ylläpitää yhteyttä Stalinin ja muiden Hän toimi marsalkka Andrey I. Jeremenkon poliittisena neuvonantajana Stalingradin (nykyinen Volgograd) puolustuksen aikana ja kenraaliluutnantti Nikolay F. Vatutinin valtavan säiliötaistelun aikana. Kurskissa.
Ukrainan vapauttamisen jälkeen vuonna 1944 Hruštšov otti uudelleen Ukrainan hallinnan Ukrainan puoluejärjestön ensimmäisenä sihteerinä. Hän työskenteli siviilihallinnon palauttamiseksi ja tuhotun maan palauttamiseksi toimeentulotasolle. Nälänhätä vuonna 1946 oli yksi pahimmista Ukrainan historiassa; Hruštšov taisteli viljatuotannon palauttamiseksi ja elintarviketuotteiden jakamiseksi Stalinin vaatimusta lisätä Ukrainasta tulevaa tuotantoa muilla alueilla. Tänä aikana Hruštšov tutustui omakohtaisesti Neuvostoliiton maatalouden niukkuuden ja suunnittelun ongelmiin. Vuonna 1949 Stalin kutsui hänet takaisin Moskovaan, jossa hän otti vanhan tehtävänsä Moskovan kaupunginpuolueen päällikkönä ja samanaikaisesti nimitettiin NLKP: n keskuskomitean sihteeriksi.
Vuosina 1949–53 oli paljon miellyttävä Hruštšoville ja muille Neuvostoliiton johtajien jäsenille, jotka löysivät sotilaita Stalinin palatsipolitiikassa. Hruštšov muutti yhä enemmän maatalouteen, jossa hän aloitti suunnitelmansa agrogorodille (”maanviljelykaupunki”) ja suuremmille valtion maatiloille perinteisten kollektiivien kustannuksella. Hänen innovaatiot hylättiin vuonna 1951, kun vastuu maataloudesta siirrettiin Georgy M.Malenkov.