Matematiikan kunniaksi uudella vuosituhannella The Clay Mathematics Institute of Cambridge, Massachusetts (CMI) perusti seitsemän palkinto-ongelmaa. Palkinnot on suunniteltu kirjaamaan joitain vaikeimpia ongelmia, joita matemaatikot kamppailivat toisen vuosituhannen vaihteessa; nostaa suuren yleisön tietoisuuteen se tosiasia, että matematiikassa raja on edelleen auki ja siinä on paljon tärkeitä ratkaisemattomia ongelmia; korostaa, että on tärkeää pyrkiä ratkaisemaan syvimmät, vaikeimmat ongelmat; ja tunnustaa historiallisen mittakaavan matematiikan saavutukset.
Palkinnot julkistettiin Pariisissa 24. toukokuuta 2000 pidetyssä kokouksessa Collège de Francessa. Esitettiin kolme luentoa: Timothy Gowers puhui matematiikan tärkeydestä; Michael Atiyah ja John Tate puhuivat itse ongelmista.
CMI: n perustava tieteellinen neuvoa-antava toimikunta valitsi seitsemän Millennium Prize -ongelmaa, joka kokoontui johtavien asiantuntijoiden kanssa ympäri maailmaa. Hallituksen painopiste oli tärkeissä klassisissa kysymyksissä, jotka ovat vastustaneet ratkaisua monien vuosien ajan.
Tieteellisen neuvottelukunnan päätöksen jälkeen CMI: n hallitus nimitti 7 miljoonan dollarin palkintorahaston ratkaisuille Nämä ongelmat on osoitettu miljoonalla dollarilla kunkin ongelman ratkaisemiseen.
On huomattava, että yksi seitsemästä Millennium Prize -ongelmasta, Riemannin hypoteesi, muotoiltu vuonna 1859, esiintyy myös kaksikymmentä kolme ongelmaa, joista keskusteltiin David Hilbertin Pariisissa 9. elokuuta 1900 pitämässä puheessa.
Palkinnon myöntämistä koskevilla säännöillä on oltava CMI: n tieteellisen neuvottelukunnan tuki ja johtajien hyväksyntä. Näiden hallitusten jäsenillä on vastuu säilyttää tämän palkinnon luonne, eheys ja henki.