NLP: n tehokkuuden määrittäminen on haastavaa useista syistä.
NLP: tä ei ole johon sovelletaan samaa tieteellistä kurinalaisuutta kuin vakiintuneemmilla terapioilla, kuten kognitiivinen käyttäytymisterapia tai CBT. NLP-palveluntarjoaja. NLP-tarjoajilla on taloudellinen intressi NLP: n menestykseen, joten heidän todisteitaan on vaikea käyttää.
Lisäksi NLP: tä koskeva tieteellinen tutkimus on tuottanut ristiriitaisia tuloksia.
Joissakin tutkimuksissa on löydetty NLP: hen liittyvät edut. Esimerkiksi lehdessä Counseling and Psychotherapy Research julkaistussa tutkimuksessa todettiin, että psykoterapiapotilailla oli parantuneet psykologiset oireet ja elämänlaatu NLP: n saamisen jälkeen verrattuna kontrolliryhmään.
Kuitenkin katsaus julkaistiin julkaisussa The British Journal of General Kymmenen saatavilla olevan NLP-tutkimuksen käytäntö oli vähemmän suotuisa.
Siinä todettiin, että NLP: n tehokkuudesta terveydentilojen, mukaan lukien ahdistuneisuushäiriöt, painonhallinta ja päihteiden väärinkäyttö, hoidossa oli vain vähän todisteita. Tämä johtui käytettävissä olevien tutkimusten rajallisesta määrästä ja laadusta eikä todisteista, jotka osoittivat, että NLP ei toiminut.
Vuonna 2014 Kanadan terveys- ja lääkeviraston raportti löysi ei kliinisiä todisteita NLP: n tehokkuudesta PTSD: n, GAD: n tai masennuksen hoidossa.
Kuitenkin vuonna 2015 julkaistussa uudessa tutkimuskatsauksessa NLP-hoidolla oli myönteinen vaikutus henkilöihin, joilla on sosiaalisia tai psykologisia ongelmat, vaikka kirjoittajien mukaan tarvitaan lisätutkimuksia.
NLP: n teoreettinen perusta on myös herättänyt kritiikkiä näyttöön perustuvan tuen puuttumisesta.
Vuonna 2009 julkaistussa artikkelissa todettiin, että kolmen vuoden kuluttua Vuosikymmenien ajan NLP: n taustalla olevat teoriat eivät olleet vieläkään uskottavia, ja todisteet sen tehokkuudesta olivat vain anekdootteja.
Vuoden 2010 katsausasiakirjassa pyrittiin arvioimaan NLP: n taustalla olevia teorioita koskevia tutkimustuloksia. Mukana olleista 33 tutkimuksesta vain 18 prosenttia todettiin tukevan NLP: n taustalla olevia teorioita.
Joten huolimatta NLP: n yli 4 vuosikymmenestä olemassaolosta, NLP: n tehokkuutta tai teorioiden pätevyyttä ei ole selvästi osoitettu vankalla tutkimuksella.
On myös syytä huomata, että tutkimusta on tehty lähinnä terapeuttisissa olosuhteissa, vain vähän tutkimuksia NLP: n tehokkuudesta kaupallisissa ympäristöissä.
Tutkiminen kuinka hyvin NLP-teoksilla on myös useita käytännön asioita, mikä lisää aihetta ympäröivää epäselvyyttä. Esimerkiksi tutkimuksia on vaikea verrata suoraan erilaisten menetelmien, tekniikoiden ja tulosten perusteella.