Leikkausta voidaan harkita pienelle osalle lapsia, joilla on vakavia tai jatkuvia sinuiittioireita lääkehoidosta huolimatta. Alle 13-vuotiailla lapsilla lääkäri saattaa neuvoa adenoidikudoksen4 poistamista nenän takaa osana sinuiitin hoitoa. Vaikka adenoidikudos ei estä suoraan sivuonteloita, adenoidikudoksen infektio, nimeltään adenoidiitti (nenän takaosan infektio, joka voi aiheuttaa tukoksen), voi aiheuttaa monia sinuiittien kaltaisia oireita – vuotava nenä, tukkoinen nenä, nenänjälkeinen tippuminen, pahanhajuinen hengitys, yskä ja päänsärky.
Vanhemmille lapsille ja niille, joille lääkehoito on epäonnistunut, adenoidektomia tai muita kirurgisia vaihtoehtoja voidaan suositella. ENT-kirurgi voi avata lapsesi poskionteloiden luonnolliset viemärireitit ja tehdä kapeista käytävistä laajempia. Tämä mahdollistaa myös infektion viljelemisen niin, että antibiootit voidaan kohdistaa nimenomaan lapsesi sinusinfektiota aiheuttaviin bakteereihin. Sinusten avaaminen mahdollistaa nenän lääkkeiden tehokkaamman jakamisen, jolloin ilma pääsee kiertämään ja yleensä vähentää sinus-infektioiden määrää ja vakavuutta.