Despertar espiritual
Es el segundo período de la vida de Ignacio, en el que se encamina hacia una vida santa, que es la más conocida. Tras el tratamiento en Pamplona, fue trasladado a Loyola en junio de 1521. Allí su estado se volvió tan grave que durante un tiempo se pensó que iba a morir. Cuando estuvo fuera de peligro, optó por someterse a una cirugía dolorosa para corregir los errores cometidos cuando se colocó el hueso por primera vez. El resultado fue una convalecencia de muchas semanas, durante las cuales leyó una vida de Cristo y un libro sobre la vida de los santos, el único material de lectura que le brindaba el castillo. También pasó el tiempo recordando historias de valor marcial y pensando en una gran dama a la que admiraba. En las primeras etapas de esta lectura forzosa, su atención se centró en los santos. La versión de las vidas de los santos que estaba leyendo contenía prólogos de las diversas vidas de un monje cisterciense que concibió el servicio de Dios como una santa caballería. Esta visión de la vida conmovió y atrajo profundamente a Ignacio. Después de mucha reflexión, decidió imitar las santas austeridades de los santos para hacer penitencia por sus pecados.
En febrero de 1522 Ignacio se despidió de su familia y se dirigió a Montserrat, un lugar de peregrinaje en el noreste de España. Pasó tres días confesando los pecados de toda su vida, colgó su espada y su daga cerca de la estatua de la Virgen María como símbolos de sus ambiciones abandonadas y, vestido de cilicio, pasó la noche del 24 de marzo en oración. Al día siguiente se dirigió a Manresa, localidad a 48 km de Barcelona, para pasar los meses decisivos de su carrera, desde el 25 de marzo de 1522 hasta mediados de febrero de 1523. Vivía de mendigo, comía y bebía con moderación. , se azotó, y durante un tiempo no se peinó ni se cortó el pelo ni se cortó las uñas. Diariamente asistía a misa y pasaba siete horas en oración, a menudo en una cueva en las afueras de Manresa.
La estancia en Manresa estuvo marcada por pruebas espirituales, así como por alegría y luz interior. Mientras estaba sentado un día a orillas del río Cardoner, “los ojos de su entendimiento comenzaron a abrirse y, sin ver ninguna visión, comprendió y conoció muchas cosas, tanto espirituales como de fe” (Autobiografía, 30) En Manresa esbozó los fundamentos de su librito Los Ejercicios Espirituales. Hasta el final de sus estudios en París (1535), continuó haciendo algunas adiciones. A partir de entonces solo hubo cambios menores hasta que el Papa Pablo III lo aprobó en 1548 Los Ejercicios Espirituales es un manual de armas espirituales que contiene un sistema vital y dinámico de espiritualidad. Durante su vida, Ignacio lo utilizó para dar retiros espirituales a otros, especialmente a sus seguidores. El folleto es en verdad una adaptación de los Evangelios para tales retiros.
El resto del período decisivo se dedicó a una peregrinación a Jerusalén. Ignacio salió de Barcelona en marzo de 1523 y, viajando por Roma, Venecia y Chipre, llegó a Jerusalén el 4 de septiembre. A ave le hubiera gustado establecerse allí de forma permanente, pero los franciscanos custodios de los santuarios de la iglesia latina no escucharon este plan. Después de visitar Betania, el Monte de los Olivos, Belén, el río Jordán y el Monte de la Tentación, Ignacio salió de Palestina el 3 de octubre y, pasando por Chipre y Venecia, llegó a Barcelona en marzo de 1524.