Attivismo e arresti domiciliari
Nel luglio 1989 il governo militare della neonata Unione del Myanmar (dal 2011, Repubblica dellUnione del Myanmar) ha posto Suu Kyi agli arresti domiciliari a Yangon (Rangoon) e lha tenuta in isolamento. I militari si sono offerti di liberarla se avesse accettato di lasciare il Myanmar, ma lei ha rifiutato di farlo fino a quando il paese non è stato restituito al governo civile e i prigionieri politici non sono stati liberati. La National League for Democracy (NLD), che Suu Kyi aveva co-fondato nel 1988, ha vinto più dell80% dei seggi parlamentari contestati nel 1990, ma i risultati di quelle elezioni sono stati ignorati dal governo militare (nel 2010 il governo militare ha formalmente annullato i risultati delle elezioni del 1990). La notizia che Suu Kyi stava ricevendo il Premio Nobel provocò unintensa diffamazione nei suoi confronti da parte del governo e, poiché era ancora detenuta, suo figlio, Alexander Aris, accettò il premio al suo posto.
Suu Kyi è stata liberata dagli arresti domiciliari nel luglio 1995, sebbene siano state imposte restrizioni alla sua capacità di viaggiare fuori Yangon. Lanno successivo ha partecipato al congresso del partito NLD, ma il governo militare ha continuato a molestare sia lei che il suo partito. Nel 1998 ha annunciato la formazione di un comitato rappresentativo che ha dichiarato essere il legittimo parlamento al governo del paese. Michael Aris è morto a Londra allinizio del 1999. Prima della sua morte, la giunta militare gli ha negato il visto per visitare Suu Kyi in Myanmar, e Suu Kyi, anticipando che non le sarebbe stato permesso di rientrare nel paese se fosse partita, è rimasta in Myanmar. .
La giunta ha nuovamente posto Suu Kyi agli arresti domiciliari dal settembre 2000 al maggio 2002, apparentemente per aver violato le restrizioni tentando di viaggiare fuori Yangon. In seguito agli scontri tra lNLD e manifestanti filogovernativi nel 2003, il governo lha riportata agli arresti domiciliari. Le richieste per la sua liberazione sono continuate in tutta la comunità internazionale nonostante il rinnovo annuale della sua condanna e nel 2009 un organismo delle Nazioni Unite ha dichiarato la sua detenzione illegale ai sensi della stessa legge del Myanmar. Nel 2008 le condizioni dei suoi arresti domiciliari sono state un po allentate, permettendole di ricevere alcune riviste e lettere dai suoi figli, che vivevano entrambi allestero.
Nel maggio 2009, poco prima della sua ultima condanna da completare, Suu Kyi è stata arrestata e accusata di aver violato i termini dei suoi arresti domiciliari dopo che un intruso (un cittadino statunitense) è entrato nella sua casa e vi ha trascorso due notti. Ad agosto è stata condannata a tre anni di carcere, anche se la pena è stata immediatamente ridotta a 18 mesi, e le è stato permesso di scontare la pena pur rimanendo agli arresti domiciliari. Al momento della sua condanna, era diffusa la convinzione sia allinterno che allesterno del Myanmar che questultima sentenza fosse stata progettata per impedire a Suu Kyi di partecipare alle elezioni parlamentari multipartitiche (le prime dal 1990) previste per il 2010.
Che il sospetto è diventato realtà grazie a una serie di nuove leggi elettorali emanate nel marzo 2010: una ha vietato a singoli individui di partecipare alle elezioni se erano stati condannati per un crimine (come era stato nel 2009), e unaltra ha squalificato chiunque fosse (o fosse stato ) sposato con un cittadino straniero in corso di candidatura. A sostegno di Suu Kyi, lNLD ha rifiutato di registrarsi nuovamente in base a quelle nuove leggi (come richiesto) ed è stata sciolta. I partiti di governo hanno affrontato poca opposizione nelle elezioni del 7 novembre 2010 e hanno vinto facilmente la stragrande maggioranza dei seggi legislativi in mezzo a diffuse accuse di frode degli elettori. Suu Kyi è stata rilasciata dagli arresti domiciliari sei giorni dopo le elezioni e ha promesso di continuare la sua opposizione al governo militare.