Holoprosencefalia nesindromică este o anomalie a dezvoltării creierului 
care afectează și capul și fața. În mod normal, creierul se împarte în două jumătăți (emisfere ) în timpul dezvoltării timpurii. Holoprosencefalia apare atunci când creierul nu reușește să se împartă corect în emisfere dreaptă și stângă. Această afecțiune se numește nesindromică pentru a o deosebi de alte tipuri de holoprosencefalie cauzate de sindroame genetice, anomalii cromozomiale sau substanțe care cauzează malformații congenitale (teratogeni). Severitatea holoprosencefaliei nesindromice variază foarte mult în rândul indivizilor afectați, chiar și în cadrul aceleiași familii.
Holoprosencefalia nesindromică poate fi grupată în patru tipuri în funcție de gradul de diviziune a creierului. De la cele mai severe la cele mai puțin severe, tipurile sunt cunoscute sub numele de alobar , semi-lobar , lobar și varianta interhemisferică mijlocie (MIHV). În cele mai severe forme de holoprosencefalie nesindromică, creierul nu se împarte deloc. Acești indivizi afectați au un ochi central (ciclopie) și o structură nazală tubulară (proboscis) situată deasupra ochiului. Majoritatea copiilor cu holoprosencefalie severă nonsindromică mor înainte de naștere sau la scurt timp. În formele mai puțin severe, creierul este parțial împărțit, iar ochii sunt, de obicei, apropiați (hipotelorism). Speranța de viață a acestor indivizi afectați variază în funcție de gravitatea simptomelor.
Persoanele cu holoprosencefalie nesindromică au adesea un cap mic (microcefalie), deși pot dezvolta o acumulare de lichid în creier (hidrocefalie) care determină mărirea mărimii capului (macrocefalie). Alte caracteristici pot include o deschidere în acoperișul gurii (palat despicat ) cu sau fără o despărțire în buza superioară (buza despicat ), un dinte central frontal în loc de doi (un singur incisiv central maxilar ) și un pod nazal plat. Globii oculari pot fi anormal de mici (microftalmie) sau absenți (anoftalmie).
Unii indivizi cu holoprosencefalie nesindromică au un model distinctiv de trăsături faciale, inclusiv o îngustare a capului la temple , colțurile exterioare ale ochilor care se îndreaptă în sus (fisuri palpebrale ascendente ), urechi mari, un nas scurt cu nările răsturnate și un spațiu larg și profund între nas și gură (philtrum). În general, severitatea trăsăturilor faciale este direct legată de severitatea anomaliilor creierului. Cu toate acestea, persoanele cu trăsături faciale ușor afectate pot avea anomalii cerebrale severe. Unele persoane nu prezintă anomalii structurale cerebrale aparente, dar au unele dintre trăsăturile faciale asociate cu această afecțiune. Acești indivizi sunt considerați a avea o formă a tulburării cunoscută sub numele de holoprosencefalie microformă și sunt de obicei identificați după nașterea unui membru al familiei grav afectat. Persoanele afectate au, de asemenea, frecvent o hipofiză care funcționează defectuos, care este o glandă situată la baza creierului care produce mai mulți hormoni. Deoarece disfuncția hipofiză duce la absența parțială sau completă a acestor hormoni, aceasta poate provoca o varietate de tulburări. Cel mai frecvent, persoanele cu holoprosencefalie nesindromică și disfuncție hipofizară dezvoltă diabet insipid, o afecțiune care perturbă echilibrul dintre aportul de lichide și excreția de urină. Disfuncția în alte părți ale creierului poate provoca convulsii, dificultăți de hrănire și probleme de reglare a temperaturii corpului, a ritmului cardiac și a respirației. Simțul mirosului poate fi diminuat (hiposmie) sau complet absent (anosmie) dacă partea creierului care procesează mirosurile este subdezvoltată sau lipsește.