Théorie des germes, en médecine, théorie selon laquelle certaines maladies sont causées par linvasion du corps par des micro-organismes, organismes trop petits pour être vus sauf au microscope . Le chimiste et microbiologiste français Louis Pasteur, le chirurgien anglais Joseph Lister et le médecin allemand Robert Koch se voient attribuer une grande partie du crédit pour le développement et lacceptation de la théorie. Au milieu du XIXe siècle, Pasteur a montré que la fermentation et la putréfaction sont causées par des organismes dans lair; dans les années 1860, Lister a révolutionné la pratique chirurgicale en utilisant lacide carbolique (phénol) pour exclure les germes atmosphériques et ainsi empêcher la putréfaction dans les fractures composées des os; et dans les années 1880, Koch a identifié les organismes responsables de la tuberculose et du choléra.
Bien que la théorie des germes ait longtemps été considérée comme prouvée, ses implications complètes pour la pratique médicale nétaient pas immédiatement apparentes; Les redingotes tachées de sang étaient considérées comme une tenue de salle dopération appropriée même à la fin des années 1870, et les chirurgiens opéraient sans masque ni couvre-chef jusque dans les années 1890.